Como organización cooperativa, SERFIR está gobernada por una asamblea General de Asociados, la cual nombra al Consejo de Administración y a un Consejo de Vigilancia.
El proceso de elección empieza cuando en una sucursal de SERFIR existen 200 socios, con el pago total de su capital social, los cuales se convocan a una Asamblea Extraordinaria Micro Regional. Con la presencia de los 200 socios se elige al delegado que los representará en la Asamblea General de Delegados.
Desde su inicio, SERFIR ha sido creada para ser administrada y gobernada de manera democrática, dentro del marco de la Ley y bajo los principios cooperativistas.
Actualmente se cuentan con Delegados Micro Regionales pertenecientes a las sucursales.
Durante el año 2005 y 2006 se llevaron acabo asambleas generales para elejir a los delegados de las diferentes sucursales.
| SUCURSAL | DELEGADO (A) |
| Angel A. Corzo | Felix Alfonso Carbajal Mendoza |
| Angelica González Morales | |
| Comitan | Reina Luz Hernández Pérez |
| Maria del C. Hernández Morales | |
| Fidel Arguello Morales | |
| Ocosingo | Virginia Pérez Flores |
| Rosaura Isabel Aguilar Cañas | |
| Siltepec | Mauricio Díaz Roblero |
| Tonala | Martin Ruíz Ovando |
| Maria Isabel De Aquino Ortiz | |
| Yajalón | Samuel Pérez Hernández |
| Rodolfo Alexis Domínguez Astudillo | |
| Villaflores | Arnulfo Díaz Rodas |
| Blanca Lidia Pineda Girón | |
| Comalcalco | Oscar Romero Hernández |
| Elio Andrés Oyosa Madrigal |
En el presente año se llavó acabo asambleas generales en las siguientes regiones:
| SUCURSAL | DELEGADO (A) |
| Motozintla | Rosa Adelina Roblero González |
| Armando González Sargento | |
| Huixtla | Trinidad Berzain Gonzalez Laparra |
| Armando Jiménez Gómez | |
| San Cristóbal | Manuel Ivan Espinosa Gallegos |
| Aida Davila Villareal | |
| Palenque | Mateo Méndez López |
| Román López González | |
| Tenosique | Neifi Zavala Trujillo |
| Guadalupe Rodríguez Gutierrez |
Se llevó acabo tambien una Asamblea General de Delegados, donde se eligió al Consejo de Administración y a un Comisario, esto con el fin de cumplir con los lineamientos marcados por la Ley.
| SUCURSAL | NOMBRE | CARGO |
| San Cristóbal | Sr. Álvaro Puig Cota | Presindente Interino del Consejo de Administración. |
| Comitan | Sra. Maria del C. Hernández Morales | Secretaria del Consejo de Administración. |
| Huixtla | Sr. Lucas Vázquez Cortés | Miembro del Consejo de Administración. |
| Villaflores | Sr. Ronay Clemente Hernández | Miembro del Consejo de Administración. |
| Tenosique | Sr. Manuel Vidal Jerónimo | Miembro del Consejo de Administración . |
| Angel A. Corzo | Sr. Felix Alfonso Carvajal Mendoza | Presindente Interino del Consejo de Administración . |
Asi mismo se eligieron a los Miembros del Consejo de Vigilancia:
| SUCURSAL | NOMBRE | CARGO |
| San Cristóbal | Sr. Germán Liévano Bautista | Presidente |
| Motozintla | Sra. Maria J. Moreno Aguilar | Miembro del Consejo de Vigilancia. |
| Tonalá | Sr. Nahún Castillo Martínez | Miembro del Consejo de Vigilancia. |
| Villaflores | Ronay Clemente Hernández | Miembro del Consejo Administración. |
En lo que se refiere a la legalidad de SERFIR, se concluyó la elaboración de las bases estatutarias, se trabajó en el convenio de Supervisión con la Federación Centro Sur y actualmente el Consejo de Administración se encuantra fizcalizado ante un Notario Público, electo en una Asamblea Ordinaria de Socios Delegados, así como los Estatutos Vigentes y las Actas correspondientes a las Asambleas de Socios efectuadas.
